Гостям музея представлены четыре экспозиции и два выставочных зала:
«Сибирский град Петров» – знакомит посетителей с ключевыми событиями и фактами Омского Прииртышья от освоения Сибири русскими до современности.
«Этническая панорама Сибири» – посвящена многообразию народов, проживающих на территории Омского края.
«Древняя история Омского Прииртышья» – представляет артефакты от эпохи верхнего палеолита до ХVIII века.
«Самой природой так заведено» – демонстрирует мир древних животных и многообразие природы Омского Прииртышья, а также результаты воздействия на нее человека.