Основу художественного собрания музея составляет коллекция коннозаводчика, владельца Прилепского конного завода Якова Ивановича Бутовича (1881-1937).
В настоящее время музей обладает крупнейшей в мире художественной коллекцией конного жанра, включающей произведения станковой живописи, графики и скульптуры, а число авторов, произведения которых находится в музее, превышает 200.